Auto-entrepreneur : toutes les étapes pour réussir sa comptabilité facilement en 2026

Bureau lumineux auto entrepreneur avec ordinateur et cafe
Sommaire de l'article

Gérer la comptabilité en auto-entreprise s’impose vite comme une étape clé pour ceux qui veulent piloter leur activité en toute simplicité. Les démarches paraissent légères par rapport à d’autres statuts, mais la moindre erreur peut coûter cher. Ce guide détaillé concentre les points essentiels à surveiller, présente des outils accessibles et partage des astuces concrètes testées par des indépendants. Si tu démarres ou si tu veux vérifier ta méthode, tu vas trouver ici les repères indispensables pour garder le contrôle, réduire les risques et optimiser ton temps.

Les obligations comptables spécifiques aux auto-entrepreneurs

Livre recettes auto entrepreneur colonne montant client
Image d’illustration

La comptabilité de l’auto-entrepreneur repose sur deux bases clés : le suivi des recettes et, pour ceux qui achètent et revendent, le suivi des achats. Tenir un livre des recettes à jour permet de suivre chaque encaissement avec précision. Ce registre est incontournable lors d’un contrôle URSSAF et peut être tenu sur Excel ou dans un carnet papier dédié. Les informations essentielles à relever :

  • Date de l’encaissement
  • Montant perçu
  • Nom du client
  • Moyen de paiement (virement, chèque, espèces…)
Date Montant Client Moyen de paiement
01/06/2026 350 € Marie Dupont Virement bancaire
08/06/2026 120 € Paul Martin Chèque

Pour les activités d’achat-revente, le registre des achats est obligatoire. Ce registre fonctionne comme le livre des recettes : chaque dépense liée à l’achat de biens ou matières destinés à la revente doit y figurer. Date, montant, fournisseur et mode de paiement sont à conserver pour chaque opération, avec les factures correspondantes comme preuve.

La facturation suit des règles strictes : mention obligatoire du numéro SIRET, description précise des prestations, montant total dû, et la mention « ,TVA non applicable, article 293 B du CGI » pour rester dans la franchise de TVA. Voici un récapitulatif des mentions clés :

Mentions obligatoires Exemple
SIRET 123 456 789 00012
TVA TVA non applicable, art. 293 B CGI
Prestations Réparation informatique
Montant total 500 €

Garder tous tes justificatifs, aussi bien au format numérique qu’en papier, est fondamental pour te prémunir contre les contrôles ou évolutions réglementaires. Une organisation rigoureuse aide à limiter les erreurs et facilite toute vérification.

Les seuils et implications fiscales à connaître en 2026

Les plafonds de chiffre d’affaires pour les auto-entrepreneurs dictent tes obligations vis-à-vis de la TVA. Voici les chiffres à retenir pour 2026 :

  • Activité d’achat-revente (BIC) : plafond à 91 900 € et seuil majoré pour la TVA à 101 000 €
  • Prestations de services ou professions libérales (BNC / BIC) : plafond à 36 800 € et seuil majoré à 39 100 €

Une fois le seuil majoré franchi, la TVA devient obligatoire. Chaque facture doit donc mentionner le taux applicable (20 % en général) et la déclaration s’effectue via le portail fiscal chaque mois ou trimestre. Pour visualiser ces données :

Seuil d’activité Plafond franchise de TVA Taux de TVA Conséquence du dépassement
Achat-revente 101 000 € 20 % TVA collectée et déclarée
Prestations de services 39 100 € 20 % Obligation d’inscription au régime réel simplifié

Le non-respect des seuils ou des déclarations entraîne des sanctions financières, parmi lesquelles une amende forfaitaire de 150 € pour les déclarations manquantes et, en cas de redressement, des intérêts de retard. Surveille tes chiffres mensuellement pour anticiper toute évolution : tu peux utiliser un logiciel ou un tableau Excel pour automatiser ce suivi.

Méthodes simples pour tenir sa comptabilité au quotidien

La réussite repose sur une routine transparente. Note chaque encaissement dans ton livre des recettes, avec date, montant, client et moyen de paiement, de façon hebdomadaire ou mensuelle selon ton rythme d’activité. Pour les achats liés à la revente, actualise le registre en intégrant chaque facture ou dépense. Un point d’organisation : classe tes justificatifs régulièrement pour éviter tout éparpillement.

  • Recense tous tes paiements dès leur arrivée.
  • Mets à jour le livre des recettes et le registre des achats mensuellement.
  • Déclare ton chiffre d’affaires via l’URSSAF (mensuel ou trimestriel selon le choix à l’inscription).
  • Vérifie la correspondance entre relevé, livre de recettes et déclaration avant validation.
  • Conserve tous les documents au moins dix ans.

Le moindre oubli, surtout dans la gestion de la TVA ou du registre des recettes, expose à une pénalité immédiate et parfois à un contrôle approfondi. Tu peux t’appuyer sur des solutions en ligne qui automatisent une partie de la saisie et facilitent l’export des données.

Les logiciels gratuits pour auto-entrepreneurs en 2026

Tableau logiciels gratuits comptabilite auto entrepreneur
Image d’illustration

De nombreux logiciels gratuits t’aident à simplifier la gestion de ta comptabilité au quotidien. Ils automatisent l’enregistrement des flux, la création des factures et la déclaration du chiffre d’affaires, tout en offrant divers niveaux de personnalisation.

Logiciel Prix gratuit Fonctionnalités clés Limites Idéal pour
Indy 0 € (Basique) Livre recettes/achats, estimation URSSAF, gestion CA 5 factures max/mois en version gratuite Débutants avec faible volume d’opérations
Abby 0 € (Illimité) Sync bancaire, création factures simultanées, gestion intuitive Optimisé pour micro-entrepreneur classique Comptabilité simplifiée sur volume moyen
Facture.net 0 € à vie Devis et factures personnalisées, export simplifié Pas de registre recettes intégré Facturation et édition sans fioritures
myAE.fr 0 € complet Livre recettes/achats, facturation conforme, modèle personnalisable Pas de fonctionnalités avancées Artisans ayant besoin de simplicité
Henrri 0 € Facturation avancée avec acomptes et relances Branding visible (mention Henrri obligatoire) Profils avec besoins de facturation précis

Par exemple, Indy propose une connexion directe à ton compte bancaire pour catégoriser automatiquement les entrées et sorties, et générer ton chiffre d’affaires en temps réel. Abby facilite la gestion grâce à sa synchronisation et son suivi des reçus et factures sans limite en version gratuite. Pour une approche plus artisanale, myAE.fr reste l’un des plus clairs pour gérer livres et registres sans se perdre dans les options.

Avant de choisir, pense à tester chaque interface gratuitement : le bon outil est celui qui correspond à ton volume d’activité et à ta façon de travailler.

Toutes les règles pour conserver ses documents comptables

Les auto-entrepreneurs doivent conserver leurs documents comptables 10 ans minimum. Cette règle s’applique au livre des recettes, registre des achats, factures, relevés URSSAF et toutes les pièces justifiant encaissements et dépenses.

  • Privilégie la double sauvegarde : classeur physique dédié et stockage numérique sécurisé (cloud type Google Drive, Dropbox ou pCloud). 
  • Active des sauvegardes automatiques si possible pour limiter le risque de perte. 
  • Si tu utilises un logiciel, vérifie qu’il permet l’export des données aux formats réglementaires.
  • Pense à une clé USB ou un disque dur externe en complément.

Pour ceux qui passent sous TVA, la gestion documentaire doit être adaptée : factures et relevés doivent mentionner la TVA collectée et être conservés selon les normes légales.

Les bonnes pratiques face au contrôle URSSAF

L’arrivée d’un contrôle URSSAF impose rigueur et préparation. Voici les points à surveiller :

  • Garde à portée de main le livre des recettes et, le cas échéant, le registre des achats.
  • Prépare toutes les factures (clients et fournisseurs) et justificatifs de paiements.
  • Présente les déclarations de chiffre d’affaires, et les relevés bancaires associés.
  • Archive les échanges URSSAF et preuves de règlement des cotisations sociales.

Contrôle la cohérence entre tes relevés bancaires et ton livre de recettes pour éviter tout écart suspect. Un suivi régulier limite les problèmes : les inspecteurs recherchent la clarté et la conformité, pas la complexité.

Réponses pratiques aux questions fréquentes sur la comptabilité auto-entrepreneur

Un logiciel de comptabilité est-il obligatoire ? Non, tu peux utiliser Excel ou un carnet papier, à condition de bien respecter les obligations (livre des recettes, registre d’achats, facturation conforme).

Quelles sont les conséquences d’un oubli dans le livre des recettes ? Oublier une entrée expose à une amende de 150 € et à des vérifications plus poussées. La régularité du suivi est le meilleur moyen d’éviter cela.

Quel logiciel choisir en début d’activité ? Indy et myAE.fr sont plébiscités pour leur simplicité et leur gratuité. Ils couvrent les besoins de base sans complexité.

Faut-il prendre un expert-comptable ? Ce n’est pas obligatoire pour une auto-entreprise, mais consulter un expert peut aider si ton activité devient plus complexe ou si tu dépasses les seuils (gestion TVA).

Comment gérer une comptabilité multi-activités ? Différencie clairement chaque activité dans ton livre des recettes, tes factures et tes déclarations URSSAF.

Auteur : Guillaume Gaborit
Expert en outils et solutions pour indépendants, rédacteur spécialisé sur touslesclics.com
Dernière mise à jour : 17/06/2026

Une gestion simplifiée et des outils adaptés, voilà de quoi aborder la comptabilité d’auto-entrepreneur sans stress ni perte de temps. Surveiller ses seuils, automatiser le suivi et s’assurer de l’archivage des documents permet de gagner en sérénité et d’éviter les mauvaises surprises lors d’un contrôle URSSAF. Quelles méthodes concrètes ou logiciels gratuits utilisez-vous pour tenir votre comptabilité au quotidien ? Partagez vos astuces avec la communauté dans les commentaires !
Si cette page vous a aidé à y voir plus clair, faites-en profiter votre réseau en la partageant.
Des sujets liés à la gestion d’entreprise ou au choix des outils vous intéressent ? Dites-le en commentaire pour que nous creusions les aspects qui vous font gagner du temps chaque semaine.

Pour des informations officielles et à jour : Service-public.fr, URSSAF.fr